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绘制细胞发育路线图有了新工具 可用于了解干细胞分化路径

  原题目:绘制细胞发育门路图有了新对象

  基于拓扑学原理,美国哥伦比亚大学研究青海网站建造公司职员开发了一个新对象,可用来描述细胞发育的多种可能路径,让科学家具体认识干细龙8娱乐娱乐网站科技资讯胞是怎样生长成为其他细胞的。相关研究揭橥在1日出书的《天然·生物手艺》杂志上。

  每个生物都始于一个细胞,厥后络续盘据。在被称为细胞分解的过程中,细胞会盘据成为特殊的细胞,如心脏细胞、骨骼细胞或脑细胞等。要认识沿着分解路径发育的细胞表里部线索,科学家能够对其进行RNA测序。但对某些细胞来说,进行RNA测序结果并不睬想,由于这些细胞平日处于分歧的发育状况。为认识决这个问题,科学家开发出单细胞RNA测序手艺,但仍必要面临分歧细胞状况之间关系的问题。

  为解决这一问题,哥伦比亚大学研究职员开发出一种称为单细胞拓扑数据阐发(scTDA)的算法。该算法可阐发单个细胞的RNA序列,重修潜在的发育轨迹,并实时捕捉分歧转录法式的希望环境。拓扑学是研究外观和外形之间空间关系的数学范畴,在这一研究中,则被用于确定分歧细胞状况和该状况下才活泼的基因之间的接洽。

  研究职员使用scTDA绘制了经诱导成为活动神经元细胞的小鼠干细胞的发育路径。这一起线图准确地评释了这些细胞的发育轨迹——从干细胞起头,至神经元竣事。通过查看哪些基因在门路图上的特定叉点附近是活泼的,就可以判定在分歧时间节点指导细胞发育的卵白质。该方式已经用于研究源自小鼠肺、人类胚胎和小鼠脑的干细胞的发育路径。

  研究职员透露,新方式使他们可以深切认识细胞的潜在命运,认识掌握细胞特性的要害分子转换,并找到使细胞发育免受负面影响的机会。他们期望以后会有更多发明,终极可以在特定发育阶段对个体细胞进行深切阐发。


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